Standard

Новые тиоцианатдегидрогеназы из сероокисляющих бактерий ThiohalobacterthiocyanaticusHRH1T и Guyparkeriasp.SCN-R1. / Shipkov N.S., Dergousova N.I., Rakitina T.V., Varfolomeeva L.A., Kulikova O.G., Tikhonova T.V., Popov V.O. ; Sorokin, Dimitry Y.

2019. 259 Abstract from II Joint Symposium of the Russian Biochemichal Society , Sochi, Russian Federation.

Research output: Contribution to conferenceAbstractScientific

Harvard

Shipkov N.S., Dergousova N.I., Rakitina T.V., Varfolomeeva L.A., Kulikova O.G., Tikhonova T.V., Popov V.O. & Sorokin, DY 2019, 'Новые тиоцианатдегидрогеназы из сероокисляющих бактерий ThiohalobacterthiocyanaticusHRH1T и Guyparkeriasp.SCN-R1' II Joint Symposium of the Russian Biochemichal Society , Sochi, Russian Federation, 1/10/19 - 6/10/19, pp. 259.

APA

Shipkov N.S., Dergousova N.I., Rakitina T.V., Varfolomeeva L.A., Kulikova O.G., Tikhonova T.V., Popov V.O., & Sorokin, D. Y. (2019). Новые тиоцианатдегидрогеназы из сероокисляющих бактерий ThiohalobacterthiocyanaticusHRH1T и Guyparkeriasp.SCN-R1. 259. Abstract from II Joint Symposium of the Russian Biochemichal Society , Sochi, Russian Federation.

Vancouver

Shipkov N.S., Dergousova N.I., Rakitina T.V., Varfolomeeva L.A., Kulikova O.G., Tikhonova T.V., Popov V.O., Sorokin DY. Новые тиоцианатдегидрогеназы из сероокисляющих бактерий ThiohalobacterthiocyanaticusHRH1T и Guyparkeriasp.SCN-R1. 2019. Abstract from II Joint Symposium of the Russian Biochemichal Society , Sochi, Russian Federation.

Author

Shipkov N.S., Dergousova N.I., Rakitina T.V., Varfolomeeva L.A., Kulikova O.G., Tikhonova T.V., Popov V.O. ; Sorokin, Dimitry Y. / Новые тиоцианатдегидрогеназы из сероокисляющих бактерий ThiohalobacterthiocyanaticusHRH1T и Guyparkeriasp.SCN-R1. Abstract from II Joint Symposium of the Russian Biochemichal Society , Sochi, Russian Federation.1 p.

BibTeX

@conference{955251b77f7c461db3ec050fbc2acfb5,
title = "Новые тиоцианатдегидрогеназы из сероокисляющих бактерий ThiohalobacterthiocyanaticusHRH1T и Guyparkeriasp.SCN-R1",
abstract = "Хемолитоавтотрофные галофильные сероокисляющие (SOB) бактерии Thiohalobacter thiocyanaticus HRh1T и Guyparkeria sp. SCN-R1 способны использовать тиоцианат в качестве единственного источника энергии, азота и серы. Ранее было пока-зано, что процесс окисления тиоцианата в этих бактериях осуществляется по “цианатному пути”. Оба генома кодируют гомо-логи медь-содержащего фермента тиоцианатдегидрогеназы (TcDH), окисляющего тиоцианат по “цианатному пути” у пред-ставителей галоалкалофильных SOB рода Thioalkalivibrio. Однако, несмотря на наличие консервативных мотивов в белке, характерных для TcDH, общая гомология аминокислотных последовательностей по отношению к TcDH из Thioalkalivibrio не превышает 34 {\%}. Кроме того, отличается окружение гена TcDH в соответствующем генном локусе. В частности, вместо си-стемы транспорта меди Cop присутствует альтернативная система Cus.TcDH из Thiohalobacter thiocyanaticus была выделена из лизата клеток, выращенных на тиоцианате. Наличие белка WP_0065748988 было подтверждено методом MALDI-TOF. Полученный препарат обладает тиоцианатдегидрогеназной актив-ностью.Для проведения дальнейших функциональных и структурных исследований гены соответствующих белков были клониро-ваны в плазмидный вектор pHIS-Parallel3. Экспрессию белков в клетках E. coli. Очистку белков проводили методом аффинной хроматографии на Ni-агарозе с последующей гель-фильтрацией. Оба рекомбинантных белка в растворе существуют в виде агрегатов с различной молекулярной массой. После насыщения полученных белков ионами меди ферментативной активности в реакции окисления тиоцианата обнаружить не удалось.Последовательности исследуемых белков содержат 6-7 остатков Cys. В кластере генов, предшествующем гену TcDH в этих бактериях, кодируется белок, принадлежащий к суперсемейству тиоредоксина. Существует вероятность, что этот белок способствует фолдингу TcDH. Для проверки этого предположения ген Guyparkeria клонировали в модифицированный плаз-мидный вектор pET-32a, содержащий тиоредоксин в качестве белка-носителя. Клетки E. coli с рекомбинантной плазмидой культивировали в среде М9 с добавлением ионов меди и микроэлементов. Очищенный рекомбинантный белок обладал мень-шей склонностью к агрегации по сравнению с полученным ранее и обладал тиоцианатдегидрогеназной активностью.",
author = "{Shipkov N.S., Dergousova N.I., Rakitina T.V., Varfolomeeva L.A., Kulikova O.G., Tikhonova T.V., Popov V.O.} and Sorokin, {Dimitry Y.}",
year = "2019",
month = "10",
language = "Russian",
pages = "259",
note = "null ; Conference date: 01-10-2019 Through 06-10-2019",

}

RIS

TY - CONF

T1 - Новые тиоцианатдегидрогеназы из сероокисляющих бактерий ThiohalobacterthiocyanaticusHRH1T и Guyparkeriasp.SCN-R1

AU - Shipkov N.S., Dergousova N.I., Rakitina T.V., Varfolomeeva L.A., Kulikova O.G., Tikhonova T.V., Popov V.O.

AU - Sorokin, Dimitry Y.

PY - 2019/10

Y1 - 2019/10

N2 - Хемолитоавтотрофные галофильные сероокисляющие (SOB) бактерии Thiohalobacter thiocyanaticus HRh1T и Guyparkeria sp. SCN-R1 способны использовать тиоцианат в качестве единственного источника энергии, азота и серы. Ранее было пока-зано, что процесс окисления тиоцианата в этих бактериях осуществляется по “цианатному пути”. Оба генома кодируют гомо-логи медь-содержащего фермента тиоцианатдегидрогеназы (TcDH), окисляющего тиоцианат по “цианатному пути” у пред-ставителей галоалкалофильных SOB рода Thioalkalivibrio. Однако, несмотря на наличие консервативных мотивов в белке, характерных для TcDH, общая гомология аминокислотных последовательностей по отношению к TcDH из Thioalkalivibrio не превышает 34 %. Кроме того, отличается окружение гена TcDH в соответствующем генном локусе. В частности, вместо си-стемы транспорта меди Cop присутствует альтернативная система Cus.TcDH из Thiohalobacter thiocyanaticus была выделена из лизата клеток, выращенных на тиоцианате. Наличие белка WP_0065748988 было подтверждено методом MALDI-TOF. Полученный препарат обладает тиоцианатдегидрогеназной актив-ностью.Для проведения дальнейших функциональных и структурных исследований гены соответствующих белков были клониро-ваны в плазмидный вектор pHIS-Parallel3. Экспрессию белков в клетках E. coli. Очистку белков проводили методом аффинной хроматографии на Ni-агарозе с последующей гель-фильтрацией. Оба рекомбинантных белка в растворе существуют в виде агрегатов с различной молекулярной массой. После насыщения полученных белков ионами меди ферментативной активности в реакции окисления тиоцианата обнаружить не удалось.Последовательности исследуемых белков содержат 6-7 остатков Cys. В кластере генов, предшествующем гену TcDH в этих бактериях, кодируется белок, принадлежащий к суперсемейству тиоредоксина. Существует вероятность, что этот белок способствует фолдингу TcDH. Для проверки этого предположения ген Guyparkeria клонировали в модифицированный плаз-мидный вектор pET-32a, содержащий тиоредоксин в качестве белка-носителя. Клетки E. coli с рекомбинантной плазмидой культивировали в среде М9 с добавлением ионов меди и микроэлементов. Очищенный рекомбинантный белок обладал мень-шей склонностью к агрегации по сравнению с полученным ранее и обладал тиоцианатдегидрогеназной активностью.

AB - Хемолитоавтотрофные галофильные сероокисляющие (SOB) бактерии Thiohalobacter thiocyanaticus HRh1T и Guyparkeria sp. SCN-R1 способны использовать тиоцианат в качестве единственного источника энергии, азота и серы. Ранее было пока-зано, что процесс окисления тиоцианата в этих бактериях осуществляется по “цианатному пути”. Оба генома кодируют гомо-логи медь-содержащего фермента тиоцианатдегидрогеназы (TcDH), окисляющего тиоцианат по “цианатному пути” у пред-ставителей галоалкалофильных SOB рода Thioalkalivibrio. Однако, несмотря на наличие консервативных мотивов в белке, характерных для TcDH, общая гомология аминокислотных последовательностей по отношению к TcDH из Thioalkalivibrio не превышает 34 %. Кроме того, отличается окружение гена TcDH в соответствующем генном локусе. В частности, вместо си-стемы транспорта меди Cop присутствует альтернативная система Cus.TcDH из Thiohalobacter thiocyanaticus была выделена из лизата клеток, выращенных на тиоцианате. Наличие белка WP_0065748988 было подтверждено методом MALDI-TOF. Полученный препарат обладает тиоцианатдегидрогеназной актив-ностью.Для проведения дальнейших функциональных и структурных исследований гены соответствующих белков были клониро-ваны в плазмидный вектор pHIS-Parallel3. Экспрессию белков в клетках E. coli. Очистку белков проводили методом аффинной хроматографии на Ni-агарозе с последующей гель-фильтрацией. Оба рекомбинантных белка в растворе существуют в виде агрегатов с различной молекулярной массой. После насыщения полученных белков ионами меди ферментативной активности в реакции окисления тиоцианата обнаружить не удалось.Последовательности исследуемых белков содержат 6-7 остатков Cys. В кластере генов, предшествующем гену TcDH в этих бактериях, кодируется белок, принадлежащий к суперсемейству тиоредоксина. Существует вероятность, что этот белок способствует фолдингу TcDH. Для проверки этого предположения ген Guyparkeria клонировали в модифицированный плаз-мидный вектор pET-32a, содержащий тиоредоксин в качестве белка-носителя. Клетки E. coli с рекомбинантной плазмидой культивировали в среде М9 с добавлением ионов меди и микроэлементов. Очищенный рекомбинантный белок обладал мень-шей склонностью к агрегации по сравнению с полученным ранее и обладал тиоцианатдегидрогеназной активностью.

M3 - Abstract

SP - 259

ER -

ID: 63132062